Voici les éléments de ces dernières semaines concernant l’actualité en génomique environnementale, un domaine de recherche fortement soutenu par le CEBA, notamment dans le cadre du programme AMAZOMICS :
– Le CEBA a organisé sa première école thématique à Kourou, du 10 au 12 octobre 2013, avec pour sujet central :
« Les méthodes nouvelles pour l’étude de la biogéographie néotropicale : le cas du plateau des Guyanes ».
Ce séminaire de formation a rassemblé 13 participants et autant de formateurs, venus de plusieurs pays : Suède, Espagne, France, Suisse, États-Unis, Colombie, Brésil.
Plus d’informations sur : https://www.labex-ceba.fr/10-12-octobre-2013-le-ceba-organise-sa-premiere-ecole-thematique-sur-la-biogeographie-neotropicale/
Participants à la première école thématique du CEBA – 10-12 octobre 2013 à Kourou, Guyane française
– À Rennes, du 4 au 6 novembre 2013, s’est tenu le colloque Génomique environnementale sur la « Diversité, évolution et fonctionnement du vivant à l’ère des nouvelles technologies de séquençage ».
À cette occasion, Lucie Zinger, post-doctorante au laboratoire EDB et membre du CEBA, a présenté un projet de cartographie de la biodiversité tropicale avec l’aide du metabarcoding, avec un zoom sur les plantes et les champignons. Elle a notamment exposé les analyses des prélèvements d’échantillons de sol effectués à la station de recherche des Nouragues, qui est l’un des principaux équipements du CEBA.
Pour plus d’informations, télécharger la présentation.
Alain Franc, chercheur du laboratoire Biogeco et membre du CEBA, y a également participé en présentant « Le calcul intensif en soutien du barcoding en métagénomique ».
Pour plus d’informations, télécharger la présentation.
Il a pris part aux ateliers sur le ‘Barcoding moléculaire et NGS’ et sur la ‘Modélisation appliquée à la génomique environnementale’.
Pour en savoir davantage sur le programme du colloque : https://colloque.inra.fr/ge_rennes2013
– Signalons également en cette fin d’année 2013 la parution de la « Prospective génomique environnementale » dans le cadre des Cahiers Prospectives édités par l’Institut écologie et environnement (INEE) du CNRS.
Parmi les auteurs, se trouvent Alain Franc, chercheur sus-cité, ainsi que deux chercheurs, Pierre Taberlet (LECA) et Frédéric Delsuc (Institut des sciences de l’évolution de Montpellier), qui ont assuré une session de formation lors de la première école thématique du CEBA.
Pour consulter la prospective, rendez-vous sur : http://www.cnrs.fr/fr/pdf/inee/inee-genomique-environnementale/
Séquences de protéines sur un écran d’ordinateur © Bertrand NICOLAS / INRA
