Le projet FUNGUY mène des inventaires mycologiques en Guyane

Quelle est l’étendue de notre connaissance et de notre méconnaissance des champignons présents en Guyane ?

Voici une question importante à laquelle entend répondre le projet FUNGUY (FUNgi en GUYane française), les Fungi correspondant, dans la taxinomie, à un règne qui regroupe environ 1,5 million d’espèces de champignons.

Lentinus aff. crinitus © Audrey Sagne

Les objectifs

FUNGUY vise à rassembler des mycologues experts en taxonomie et des écologues sur le terrain avec plusieurs objectifs :
–  établir un inventaire des champignons associés aux arbres (endophytes et saprotrophes) sur des sites dont la diversité et la structure de la communauté végétale sont étudiées ;
–  préciser le mode de nutrition de certains de ces champignons ;
–  mettre en place sur ces sites le suivi de la dynamique spatiale et temporelle des fructifications de champignons.
Ce projet a été monté par Mélanie Roy du Laboratoire EDB (Evolution et Diversité Biologique – Toulouse) et Heidy Schimann de l’UMR EcoFoG (Ecologie des Forêts de Guyane – Kourou) et sélectionné dans le cadre de l’Appel à projets 2011 du CEBA.
 

 Camillea cyclops © Audrey Sagne

Des missions de terrain

La première phase de ce projet consiste à réaliser des inventaires pour identifier, échantillonner et localiser les carpophores (voir définition ci-dessous) sur deux sites : les Nouragues et Paracou, dont les parcelles sont étudiées dans le cadre de Metabar (projet de séquençage d’ADN environnemental). Ce sont des zones où la diversité des plantes est déjà bien connue.
Une première mission a été menée en juin-juillet 2012 : pendant 15 jours, une équipe de 12 personnes a parcouru ces deux sites. Ont été invités des mycologues spécialistes des différents groupes de champignons par rapport aux plantes : experts mycologues de diverses universités (Régis Courtecuisse et Stéphane Welti de Lille 2, Terry Henkel de Humboldt – États-Unis et Cony Decock de Louvain – Belgique), Hubert Voiry et Gérald Gruhn (personnel de l’ONF) ainsi que Jacques Fournier et Christian Lechat, mycologues amateurs de haut niveau.
Audrey Sagne, future doctorante, faisait également partie de l’équipe. Son sujet de thèse porte sur la distribution spatiale des communautés de champignons et notamment leur structuration en relation avec les communautés végétales.
Pour en savoir plus sur cette première mission, téléchargez le Livret mission FunGUY.

Des réponses, déjà ?

Les premiers résultats de cette mission témoignent de l’étendue de notre méconnaissance : sur les 991 champignons observés, seuls 224 ont pu être identifiés comme appartenant à des espèces connues. Sur l’ensemble, 113 genres ont été mentionnés. Pourtant, 209 échantillons, sur plus de 1100 échantillons au total, restent incertains même au niveau du genre.
Ces chiffres sont préliminaires car l’identification se fait essentiellement après observation sous le microscope et par comparaison aux échantillons des mycothèques (herbiers). On peut retenir que 78% des échantillons ne sont pas encore identifiés au-delà de la famille ou du genre. Ce sont probablement des nouveautés, en tout cas du jamais vu pour ces experts pourtant familiers avec la fonge du Guyana ou des Antilles, et qui sont déjà venus en Guyane il y a quelques années.

Hygrocybe sp. © Audrey Sagne

Des projets pour la suite

Une mission sera organisée dans les mois prochains, sans doute en décembre-janvier, avec d’autres experts. Il s’agira notamment d’estimer le taux de recouvrement entre deux échantillonnages. Il semble que les espèces vues lors de missions précédentes n’aient pas été revues pendant cette dernière sortie terrain, ce qui indique l’existence d’une très grande diversité de champignons.
 

Xylariales sp. © Audrey Sagne

Définition

Carpophore (ou sporophore) : c’est l’organe de la fructification du mycélium des Fungi. C’est la partie visible de l’organisme, c’est ce qu’en langage courant, on appelle un « champignon ». Typiquement, il est formé d’un chapeau et d’un stipe ou « pied ».