La soutenance publique aura lieu en salle Silvolab, UMR EcoFoG (Campus Agronomique, Kourou) et sera accessible à distance : https://inrae-fr.zoom.us/j/7481960098#success
Résumé : Les derniers scénarios du GIEC prévoient une intensification des sécheresses dans l’est de l’Amazonie. Dans ces forêts, et en particulier en Guyane française, deux grands types d’habitats forestiers coexistent et se distinguent principalement par leur fertilité et leur drainage : les habitats forestiers de terre firme et de bas-fond. Les espèces d’arbres généralistes sont répartis à travers ces deux habitats, tandis que les espèces spécialistes sont spécifiques à l’un ou l’autre de ces habitats. Face à un stress abiotique tel que la sécheresse, la défaillance hydraulique semble être l’un des principaux mécanismes conduisant à la mortalité des arbres. Il est donc important de caractériser la variabilité intraspécifique et interspécifique des traits liés au fonctionnement hydrique des feuilles chez les généralistes et les spécialistes. De plus, les micro-organismes qui colonisent les différents organes des plantes sont fortement impliqués dans la résistance au stress en tant que modulateurs des réponses phénotypiques des plantes. En me concentrant sur l’habitat des bas-fonds, j’explore les stratégies de résistance et résilience à la sécheresse des arbres tropicaux et des micro-organismes qui leur sont associés. Dans ma thèse, j’étudie essentiellement les deux questions suivantes : (1) Quelles sont les stratégies fonctionnelles des arbres tropicaux dans et entre les différents habitats, et (2) quel rôle les communautés microbiennes associées jouent-elles dans la réponse des arbres à la sécheresse ? Mon sujet de thèse s’attache ainsi à déterminer la réponse des arbres tropicaux face aux climats du futur. Pour cela, j’utilise une approche originale combinant l’écophysiologie des arbres et l’écologie microbienne. Je caractérise d’une part les stratégies de réponse des espèces d’arbres dans des milieux contrastés à l’aide de traits liés à la gestion de l’eau. D’autre part, je caractérise la composition et la diversité des communautés des microbiotes associés aux feuilles et aux racines par des méthodes de séquençage à haut-débit. A l’aide de mesures sur le terrain combinées à des expérimentations menées en serre en conditions semi-contrôlées, j’explore différents scénarios de sécheresses afin de comprendre les mécanismes de résistance et de résilience des espèces d’arbres tropicaux.
Abstract: The latest IPCC scenarios predict a worsening of drought in the eastern Amazon. In these forests, and in French Guiana in particular, two main types of forest habitat coexist, distinguished mainly by their fertility and drainage: terra firme and seasonally flooded forest habitats. There are generalisttree species that thrive in a wide range of forest habitats, while specialist species are more habitat-specific. In the face of abiotic stress such as drought, hydraulic failure appears to be one of the major mechanisms leading to tree mortality. It is therefore relevant to characterize intraspecific and interspecific variability in leaf water-related traits within generalists and specialists. Additionally, microorganisms that colonize different plant organs are strongly implicated in stress tolerance as modulators of plant phenotypic responses. Focusing on the seasonally flooded forest habitat for its potential vulnerability to climate change, I explore the drought resilience strategies of tropical trees and their associated microorganisms. In my thesis, I mainly investigated the two following questions: (1) What are the functional strategies of tropical trees within and between different habitats, and (2) what role do the associated microbial communities play in trees’ response to drought? My thesis topic therefore aims to determine the intraspecific and interspecific responses of tropical trees to contrasting habitats and to future climates. To do so, I combine tree ecophysiology and microbial ecology. On the one hand, I characterize the response strategies of tree species in contrasting environments using ecophysiological traits. On the other hand, I characterize the community composition and diversity of leaf and root associated microbiota using high throughput sequencing methods. Using field measurements combined with semi-controlled greenhouse experiments, I explore different drought scenarios to understand the resistance and recovery of tree species.
